Le RECIF a été créé en 1988 à Lyon à l'initiative de Charles Mérieux par trois partenaires:
. L'Université Claude Bernard Lyon 1
. La Fondation Mérieux
. Les Hospices Civils de Lyon
Au décès de Charles Mérieux, la fondation Mérieux s'est retirée du RECIF pour céder la place à Trace Eléments - institut pour l'UNESCO. Les trois partenaires du RECIF mettent à sa disposition du personnel administratif et hospitalier, des locaux et des moyens financiers.
Après avoir formé une équipe lyonnaise de cliniciens épidémiologistes dans des pays anglophones (Etats-Unis, Canada et Australie), le RECIF a lancé son premier enseignement à Lyon. Il a noué des liens avec des pays francophones en organisant des séminaires intensifs régionaux. Les contacts avec les cliniciens étrangers se sont multipliés et ont abouti à la création d'Unités d'Epidémiologie Clinique (UEC) puis de Centres d'Enseignement et de Ressources en Epidémiologie Clinique (CEREC) accrédités par le RECIF et reconnus par l'INCLEN.
1992: accréditation de l'UEC de Lyon par l'INCLEN
1998: accréditation du CEREC de Lyon par l'INCLEN
2001: accréditation par le RECIF des UEC de Bucarest et de Iasi (Roumanie)
2004: accréditation par le RECIF des CEREC de Lausanne (Suisse) et de Laval (Québec) et de l'UEC d'Amiens (France)
2006: accréditation par le RECIF de l'UEC de Tirgu Mures (Roumanie)
2008 : accréditation par le RECIF de l'UEC d'Annaba (Algérie)
2012 : accrédiatation par le RECIF de l'UEc de Cluj (Roumanie)